FLASHのFPSを正常にする方法があるらしいです。
winのIE6ではswfムービーの再生速度が遅くなるらしく(分からなかった・・・)
どんなに処理の軽いswfムービーを作ったとしても、IE6では指定した再生速度から
約10%減のスピードしか出ないなんて・・・。
で、その改善方法が紹介されていました。

HTMLに貼り付けるembedの中に
＜param name="wmode" value="opaque" /＞
を加えるだけです。
これだけで実行速度が目に見えて変わるから驚きですね。

ただ全てのswfムービーが軽くなるわけではなく、比較的に処理の少ないファイル
とからしいです。
モノによっては遅くなったりもするらしいので試してみれば良いかも知れませんね。